Černák bol Krajskou prokuratúrou v Trenčíne obžalovaný zo zosnovania útoku na Jozefa Holuba. Čin sa stal začiatkom októbra 1997 v Košiciach, pri ktorom bol v byte Jozefa Holuba zastrelený Peter Klešč, Holub pred útočníkmi ušiel cez okno. Ako uviedla predsedníčka senátu, prokuratúra sa v tomto prípade opierala hlavne o výpoveď Alexandra H., ktorý počas procesu zmenil výpoveď. Súdu neboli predložené ani iné dostatočne presvedčivé dôkazy, ktoré by usvedčili Mikuláša Černáka z účasti na tejto vražde. Obžaloba pre Mikuláša Černáka žiadala výnimočný trest v dolnej polovici trestnej sadzby. Prokurátorka sa po vynesení rozsudku vyjadrila, že v zákonnej lehote rozhodne, či sa proti rozsudku odvolá.
Oslobodzujúci rozsudok padol aj v prípade Slavomíra Surového, ktorého prokuratúra obžalovala z trestného činu vraždy spolupáchateľstvom, v tom istom trestnom čine. Obžaloba v jeho prípade bola rozšírená aj o trestný čin porušovania domovej slobody. Za spáchanie týchto skutkov žiadala hornú hranicu trestu z možnej sadzby 12 – 15 rokov. Napokon prokurátorka sa vzdala odvolania proti rozsudku. Jediného z trojice obžalovaných Ladislava Bada dnes uznal senát vinným a za trestný čin vraždy Jána Kromku bol odsúdený na súhrnný trest 12 rokov v tretej nápravnovýchovnej skupine. Súd mu zároveň udelil ochranný dohľad v trvaní troch rokov. Ladislav Bado bol oslobodený z druhého činu – vraždy Petra Klešča. Proti rozsudku sa odvolá. Rozsudok zatiaľ nie je právoplatný.
Mikuláš Černák dnes pred súdom vyhlásil, že nie je žiadny masový vrah a vo väzení je vraj iba preto, že odmietol spolupracovať s políciou. „Moje kauzy sú sprevádzané politickými tlakmi a to len preto, že som nesúhlasil vypovedať proti Lexovi a Mečiarovi,“ uviedol v záverečných rečiach. Jeden z jeho obhajcov Ľudovít Samuel hovoril o tlakoch bývalej vlády, ktorá mala mať záujem na väznení Černáka. \"Je mediálne známe, že Mikuláš Dzurinda sa vyjadril, že kým on bude premiérom, tak sa Mikuláš Černák nedostane z basy von,\" povedal na hlavnom pojednávaní. S rozsudkom bol spokojný. Proces s Mikulášom Černákom začal 16. mája a bol niekoľkokrát prerušený. Trestný spis mal vyše 2 200 strán. Súd vypočul 35 svedkov a osem súdnych znalcov.
(mm)