Tak metropolita tejto cirkvi Nikolaj, ako aj dekan fakulty Peter Kormaník a ďalší slávnostní rečníci, o. i. generálny konzul ČSR v SR Josef Byrtus, ocenili, že fakulta vydržala všetky skúšky a pokračuje v plnení svojej cyrilo-metodskej misie. Dovedna ju absolvovalo vyše 400 duchovných, ktorí boli nielen zo Slovenska či Česka, ale aj z Ruska, Ukrajiny, Rumunska, Poľska, Etiópie. Pri svojom založení mala fakulta šesť katedier a to až do roku 1990, keď prešla spod riadenia ministerstvom kultúry do zväzku fakúlt Univerzity Pavla Jozefa Šafárika a následne v roku 1997 bola zakladajúcou fakultou PU.
Fakulta má v súčasnosti deväť katedier a do rôznych foriem štúdia sa v školskom roku 2000/2001 zapísalo 371 poslucháčov. Mnohí z nich nie sú členmi pravoslávnej cirkvi. Svoje detašované pracovisko má v Olomouci. Ako prvá z piatich fakúlt PU úspešne toho roku zvládla nový akreditačný proces a má právo konať štátne záverečné skúšky zo študijného odboru pravoslávna teológia a učiteľstvo všeobecnovzdelávacích predmetov so špecializáciou etika a náboženská výchova a na štúdium popri zamestnaní v odbore sociálna práca.